Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ARXQ96QS3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARXQ96QS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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