Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms