Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
C2orf48Q96LS8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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C2orf48Q96LS8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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C2orf48Q96LS8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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C2orf48Q96LS8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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C2orf48Q96LS8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf48Q96LS8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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