Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMARCE1Q969G3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms