Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM171Q8WVE6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms