Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB3IL1Q8TBN0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms