Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELBQ8NG08 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HELBQ8NG08 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms