Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms