Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP13Q86W25 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP13Q86W25 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms