Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE3BQ7Z3V4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms