Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC27A4Q6P1M0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms