Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATL3Q6DD88 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms