Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLX4IPQ5VYV7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms