Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GARNL3Q5VVW2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GARNL3Q5VVW2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms