Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FRMPD1Q5SYB0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FRMPD1Q5SYB0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms