Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CEP170Q5SW79 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CEP170Q5SW79 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms