Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFT2D3Q587I9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms