Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms