Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP41Q3LFD5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms