Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
QSER1Q2KHR3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms