Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GEN1Q17RS7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GEN1Q17RS7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GEN1Q17RS7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GEN1Q17RS7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GEN1Q17RS7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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