Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
LAMA3Q16787 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LAMA3Q16787 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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