Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN9AQ15858 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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