Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC23BQ15437 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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