Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GINS1Q14691 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GINS1Q14691 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms