Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMC1AQ14683 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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