Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BECN1Q14457 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BECN1Q14457 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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