Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM25Q14258 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms