Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CNGB1Q14028 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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CNGB1Q14028 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGB1Q14028 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGB1Q14028 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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