Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3FQ13275 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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