Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCAPQ12770 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCAPQ12770 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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