Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IFFO1Q0D2I5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IFFO1Q0D2I5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms