Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCL9Q07325 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCL9Q07325 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms