Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POU5F1Q01860 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POU5F1Q01860 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms