Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VLDLRP98155 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms