Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHC1P78364 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHC1P78364 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms