Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA2P62736 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms