Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTBP60709 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTBP60709 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTBP60709 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTBP60709 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms