Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms