Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP98P52948 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP98P52948 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP98P52948 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms