Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LUMP51884 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LUMP51884 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LUMP51884 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LUMP51884 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms