Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSEN1P49768 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSEN1P49768 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms