Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UTRNP46939 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UTRNP46939 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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UTRNP46939 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UTRNP46939 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UTRNP46939 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UTRNP46939 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UTRNP46939 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTRNP46939 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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