Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP5P45974 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP5P45974 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP5P45974 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP5P45974 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms