Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCAMP43121 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCAMP43121 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCAMP43121 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCAMP43121 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms