Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP5C1P36542 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATP5C1P36542 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms