Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
USP6P35125 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP6P35125 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP6P35125 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP6P35125 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP6P35125 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP6P35125 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP6P35125 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP6P35125 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms