Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
OTX2P32243 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
OTX2P32243 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
OTX2P32243 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
OTX2P32243 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms