Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.62-201ENST00000619972 268 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP000844.2-201ENST00000419440 509 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC053513.1-201ENST00000543604 738 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AC012339.1-201ENST00000505564 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 KLF3-AS1-205ENST00000507091 642 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 AP002852.2-201ENST00000519630 740 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD11P31277 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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