Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A5P29400 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A5P29400 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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